Wydawnictwo Uniwersytetu Mikołaja Kopernika działa od 13 lutego 1967 roku jako jednostka ogólnouczelniana Uniwersytetu.

Wydawnictwo regularnie uczestniczy w kiermaszach i targach książki w Polsce i za granicą. Od kilku lat prezentujemy nasze publikacje na Targach Książki Akademickiej Atena w Warszawie, obecnie są to targi Akademia, i Targów Książki Naukowej we Wrocławiu. W 1997 roku wzięliśmy pierwszy raz udział w I Targach Książki w Krakowie i w Poznaniu i od tego czasu jesteśmy tam co roku. W maju 1998 roku po raz pierwszy byliśmy obecni jako wystawcy na Międzynarodowych Targach Książki w Warszawie. Wspomniane imprezy targowe pragniemy traktować co roku jako obowiązkowe, aby promować nasze publikacje, a za ich sprawą Uniwersytet Mikołaja Kopernika.

Książki Wydawnictwa Naukowego UMK były wielokrotnie nagradzane .