Ostatnie lata, śmierć, turecki proces
W ostatnich latach życia Burroughs występuje w reklamach (Nike, GAP), nagrywa audiobooki "Ćpuna" i "Nagiego lunchu", występuje w teledysku U2, nagrywa głos do gry wideo i trafia na sztandary epoki informacji.
1 sierpnia 1997 roku Burroughsa ma atak serca. Trafia do szpitala, umiera następnego dnia rano. Uroczystości pogrzebowe odbywają się 6 sierpnia w Lawrence. Pisarz zostaje pochowany w rodzinnym grobowcu w Saint Louis.
W 2011 roku przed sądem w Istambule stają wydawca i tłumacz odpowiedzialni za turecką edycję "Delikatnego Mechanizmu" Burroughsa. Zarzut: rozpowszechnianie obscenicznych treści. Sąd przełożył ostateczne rozpatrzenie sprawy do 2015 roku.