Trudny wybór
Guru przestał wierzyć w rozsądek Cruise'a w kwestii wybierania sobie partnerek i postanowił sam się tym zająć. Dokonano castingu wśród ponad stu kandydatek. Wygrała go niejaka Nazanin Boniadi, jednak zaprzepaściła swoją szansę nie wykazując należytego szacunku Miscavige'owi, więc czym prędzej ją odprawiono. Za karę musiała czyścić toalety szczoteczką do zębów i kopać rowy - na szczęście włożyła w to tyle serca i pasji, że scjentolodzy przyjęli to ukorzenie i pozwolili jej odzyskać statut w Kościele. Nadal jednak trzeba było szukać partnerki dla narzekającego na samotność Cruise'a. Sofia Vegara nie chciała zostać scjentolożką, więc w zasadzie nie zdążyła rozpakować walizek w posiadłości aktora. Celebrity Centre wizytowały kolejne kandydatki, od Jessiki Alby po Scarlett Johansson, aż w końcu zjawiła się tam Katie Holmes. Miscavige łaskawie zaakceptował tę absolwentkę katolickiej szkoły dla dziewcząt mówiącą o sobie, że jest 26-letnią dziewicą. Po kilkunastu dniach wprowadziła się do rezydencji Cruise'a w
Beverly Hills. 18 listopada 2006 roku wzięli ślub. Niestety, Holmes nie najlepiej reagowała na indoktrynację i pranie mózgu, będące immanentną częścią scjentologii. W czerwcu 2012 roku złożyła pozew o rozwód. Obecnie mówi się, że Cruise jest związany z Mirandą Kerr, pozostaje pytanie, czy Miscavige pozwoli by ten związek trwał.