na zdjęciu: borsunio wyprowadza Rysia na spacer
Te najcenniejsze zostały wywiezione do Trzeciej Rzeszy. Opustoszałe pomieszczenia Jan Żabiński, dyrektor ogrodu, wraz z żoną Antoniną wykorzystywali ukrywając Żydów uciekających z terenów warszawskiego getta. Wielu z nich Żabiński osobiście wyprowadził z getta, po którym miał prawo poruszać się pod pozorem poszukiwania odpadów do karmienia świń, hodowanych wówczas na terenie ogrodu.