Wydawnictwo Drzewo Babel powstało 22 maja 1995 roku. Oficynę założyła Basia Stępień z przyjaciółką Joanną Jaczyńską. Pierwszą opublikowaną książką był Alchemik Paulo Coelho.

Na nazwę Drzewo Babel składają się dwa symbole: sięgających głęboko korzeni i wielokulturowości. W 2001 r. Joanna Jaczyńska odeszła z wydawnictwa i przeniosła się do Nowego Jorku.

Drzewo Babel to maleńka oficyna wydawnicza, w której pracują 3 osoby.